冲水
纽约大学菲利普·泰尔诺博士指出，如果冲水时马桶盖打开，马桶内的瞬间气旋最高可以将病菌或微生物带到6米高的空中，并悬浮在空气中长达几小时，进而落在墙壁和物品上。现 在大部分家庭 中，如厕、洗漱、淋浴都在卫生间里 进行，牙刷、漱口杯、毛巾等与马桶共处一室，自然很 容易受到细菌污染。因此，应养成冲水时盖上马桶盖的习惯。
清洗
1)马桶圈细菌多要重点清新
32%的马桶上有痢疾杆菌，其中一种名为“宋内”的痢疾杆菌在马桶圈上存活的时间长达17天;另一份实验 报告也指出，将1亿个脊髓灰质炎病毒投入马桶内，溅到座圈上的病毒竟有 3000个。同时，不少人冬天喜欢在马桶上套个绒布垫圈，这样更容易吸附、滞留排泄污染物，传播疾病的可能性更大。
污染如此严重的地方恰恰和人们皮肤的接触最“亲密”，因此要重点进行清洁，每隔一两天应用稀释的家用消毒液擦拭。至于布制的垫圈最好不用，如果一定要使用的话，应经常清洗消毒。如果有条件，不妨换一个具有抗菌功能和防溅设计的座便器。
2)马桶内的脏物及时清洗
马桶容易沾染尿渍、粪便等污物，冲水后如果发现仍留有残迹，一定要及时用马桶刷清除干净，否则容易形成黄斑污渍，也会滋生霉菌和细菌。除了管道口附近，马桶内缘出水口处和底座外侧都是藏污纳垢的地方，清洗时先把马桶圈掀起，并用洁厕剂喷淋内部，数分钟后，再用马桶刷彻底刷洗一遍，最好用细头的刷子，这样能更好地清洁马桶内缘和管道口深处。然后再刷洗底座和其他缝隙。
3)马桶边尽量不设废纸篓
平时也可以在水箱中放置渐溶式自动洁厕剂或挂上壁挂式消毒栓，通过每次冲洗达到清洁、除垢、消毒除菌的效果。
大多数家庭都会在马桶边设一个废纸篓，存放使用过的厕纸，但这样会造成细菌随空气散播，因为很少有人能做到随时清理，至少都会存放一两天，而时间越长，滋生的细菌就越多。
应该将厕纸丢进马桶内冲走，只要不是太厚、太韧，厕纸一般都能在水中很快变软，所以不用担心堵塞。有需要时，备一个卫生袋就可以，没必要再设废纸篓。如果一定要用，也要选带盖子的，以防细菌散播，并及时处理用过的厕纸。
4)马桶刷要保持清洁干燥
马桶刷是保持马桶清洁的功臣，然而，如果不注意清洁和干燥，它也会成为污染源。每次刷完污垢，刷子上 难免会沾上脏物，最好随手再冲一次水，将其冲洗干净，把水沥干，喷洒消毒液，或定期用消毒液浸泡，并放在合适的地方。
专家建议，最好把马桶刷挂起来，不要随便放在角落里，也不要放在不透风的容器里。
5)清洁马桶重要性
复旦大学公共卫生学院郁庆福教授指出，调查发现，32%的马桶上有痢疾杆菌。另一份实验报告也指出，将1亿个脊髓灰质炎病毒投入 马桶内，溅到座圈上的病毒竟有3000个。现 在大部分家庭中，如厕、洗漱、淋浴都在卫生间里进行，牙刷、漱口杯、毛巾等与马桶共处一室，自然很容易受到细菌污染。而马桶的细菌主要来源于排泄物以及马桶长时间因为清洁不当而留存在壁上的污垢和细菌。
6)家庭马桶清洁重点
天天使用双色双效洁厕宝，只需将洁厕宝放入马桶水箱。通过每次冲水就可达到清洁和除菌的功效。在使用洁厕宝的同时，也需要定期使用洁厕液。一般家庭1-2周。使用洁厕液清洗马桶，讲留存在马桶壁上的污垢细菌再次用马桶刷刷洗干净。每隔一两天应用稀释的家用消毒液擦拭马桶圈。
马桶的保养方法
1、勿置于阳光直射之下、直接热源附近或暴露在油烟处，否则会导致变色。
2、勿置硬物及重物，如水箱盖、花盆、水桶、盆等，否则会划花表面或导致开裂。
3、盖板和座圈宜用软布清洁，禁用强酸、强碳和去污粉清洁勿使用挥发剂、稀释剂或其它化学物清洗，否则会腐蚀表面。勿使用钢丝刷、刀片等锋利器物清洁。
4、盖板装在无水箱、低水箱时，人不可向后靠，否则会导致折断。
5、盖板应轻开轻关，避免与水箱直接碰撞留下斑痕而影响美观;或可能导致断裂。
6、使用金属座铰(金属镙丝)的产品要注意，不要让有酸碱性的溶剂附在产品上，否则容易锈化。