我国对水蛭的药用价值认识很早，在约一千年之前，《神农本草经》、《本经》等古代医学书籍中均有对水蛭的记载。
1、水蛭具有祛瘀消肿、消炎解读的功效。而现代的医学研究与临床证明，水蛭含有的水蛭素、肝素、抗血栓素和组织胺样等，可以治疗中风、心绞痛、闭经、跌打损伤、高血压、心力衰竭、心肌梗塞等疾病，特别是对高血脂有非常好的治疗效果。
2、水蛭对血液和血管系统有突出的作用。水蛭素可以阻碍血液凝固，水蛭水可以抗血栓，防止血液浓稠。而且水蛭对组织缺血缺氧有保护作用，可以扩张毛细血管、改善微循环、增加肾脏血流量。
3、除此之外，水蛭还可以防止早产，对高血脂的胆固醇和甘油三酯有明显的降低作用，还具有抗癌作用，能杀死癌细胞。整形外科医生还会用水蛭消除手术后病人血管闭塞区的淤血，减少坏死的发生，利用水蛭吸血，可以让静脉血管通畅提高手术的成功率。
4、现在，大量的水蛭被应用于制作药物，如溶栓胶囊、活血通脉胶囊、逐瘀活血胶囊、血栓心脉宁、通心络、活血通、脑血康、疏血痛注射液、抗血栓片等等，这些药品投入市场后已成畅销品，且对改善老年人疾病发挥了巨大作用。
因为水蛭的药用价值非常大，现在对水蛭的栽培繁殖也在增多，利用水蛭可以治疗许多疾病成为人们的共识，几时它会吸血，可能是其他地方它有坏处，但是在治疗疾病方面它是非常重要的。